Foi apanhado numa conspiração para derrubar a República, juntamente com os seguidores de Paiva Couceiro. A Guarda Civil, por ordem expressa do Governador Civil de Viana, apareceu inesperadamente para prendê-lo na Casa da Brêa. Após lhe terem dado voz de prisão, o Reitor disse-lhes que antes de o levarem fazia questão de se despedir de seus pais, o que eles, com o devido respeito, acederam. Entrou então no corredor da cozinha para se despedir e, num instante, pega no chapéu de palha do cunhado, Manuel Fernandes Couto Soares, que o tinha ido visitar e estava na cozinha, veste o casaco de sulfatar do pai e foge para a Quinta de Santo Isidoro, em S. Salvador da Torre.

Ali permaneceu escondido, aproximadamente seis meses, no quarto do dono e seu grande amigo, sendo este que, secretamente, o alimentava e cuidava dele, sem que ninguém suspeitasse. Entretanto, escapou-se da Quinta e foi passar a Consoada de Natal com seus irmãos na Residência do Abade de Meixedo, seu irmão, Pe. António Joaquim Soares Borlido. No dia seguinte, pela calada da noite, seguiu a pé até Lanhelas, de onde atravessou o rio Minho para a Galiza, Espanha, não se sabendo com que meios e apoios, onde vivia seu tio João Francisco Gonçalves Borlido, casado com Maria da Pas Labalhos J. Conde, do Reynno de Hespanha.